Theo đánh giá của Viện Tài nguyên môi trường, căn cứ trên kết quả khảo sát việc xả nước thải của Cty Vedan từ tháng 2/2008 đến khi phát hiện hệ thống xả thải trái phép của Cty này ra sông Thị Vải (tháng 9/2008), bình quân mỗi tháng Cty Vedan xả ra sông Thị Vải 105.600 m3 nước thải với các chỉ số ô nhiễm vượt mức cho phép hàng trăm đến hàng ngàn lần.

Kết quả khảo sát mới đây cho thấy bán kính vùng ô nhiễm trên sông Thị Vải đoạn từ Cty Vedan đổ về hạ lưu khoảng 4,4 km, Viện Tài nguyên môi trường xác định 80% đến 90% ô nhiễm là do Cty Vedan gây ra, số còn lại là các tác nhân khác và các khu công nghiệp có doanh nghiệp xả thải ra sông Thị Vải.

Diện tích nuôi trồng thủy sản bị ảnh hưởng do ô nhiễm từ sông Thị Vải được xác định, tỉnh Đồng Nai bị thiệt hại nặng trên 1.700 ha và 56,54 ha bị ảnh hưởng nhẹ tỉnh Bà Rịa - Vũng Tàu có 326,28 ha diện tích nuôi trồng bị ảnh hưởng nặng. Còn tại TP HCM, có xã Thạnh An huyện Cần Giờ bị thiệt hại do nước thải Vedan (đang xác định diện tích).

Đại diện Cty Vedan cho rằng Cty Vedan tôn trọng kết quả nghiên cứu đánh giá thiệt hại của các nhà khoa học Việt Nam. Tuy nhiên, Vedan vẫn chưa nhất trí với số liệu khẳng định 80% đến 90% thiệt hại ô nhiễm sông Thị Vải là do Vedan gây ra.