Theo đó, Quyết định về việc hỗ trợ có mục tiêu kinh phí trên đây áp dụng cho các cơ sở thuộc khu vực công ích tại Quyết định số 64/2003/QĐ-TTg ngày 22/4/2003 của Thủ tướng Chính phủ về việc phê duyệt "Kế hoạch xử lý triệt để các cơ sở gây ô nhiễm môi trường nghiêm trọng" và các cơ sở gây ô nhiễm nghiêm trọng khác thuộc khu vực công ích mới phát sinh. Đó là: kho thuốc bảo vệ thực vật bệnh viện bãi rác điểm tồn lưu chất độc hóa học do Mỹ sử dụng trong chiến tranh và trạm xử lý nước thải sinh hoạt đô thị. Thủ tướng Chính phủ cũng quy định rõ nguyên tắc hỗ trợ : Hỗ trợ 100% kinh phí từ nguồn ngân sách Trung ương đối với các dự án do Bộ, cơ quan ngang Bộ, cơ quan trực thuộc Chính phủ quản lý. Hỗ trợ 100% kinh phí từ ngân sách địa phương đối với các dự án do Ủy ban nhân dân tỉnh, thành phố trực thuộc Trung ương quản lý ... Đối với tỉnh, thành phố trực thuộc Trung ương còn nhận trợ cấp cân đối từ ngân sách Trung ương sẽ được ngân sách Trung ương hỗ trợ có mục tiêu kinh phí cho địa phương bằng 50% tổng kinh phí của dự án xử lý triệt để ô nhiễm môi trường để thực hiện, ngân sách địa phương chịu trách nhiệm hỗ trợ 50 %.
Nguồn kinh phí hỗ trợ được lấy từ kinh phí sự nghiệp môi trường vốn đầu tư phát triển vốn vay ODA vốn vay từ các tổ chức tín dụng vốn viện trợ vốn vay từ các quỹ bảo vệ môi trường các cấp và các tổ chức cá nhân trong và ngoài nước.
Thủ tướng Chính phủ giao cho Bộ Tài nguyên và Môi trường chủ trì phối hợp với Bộ Kế hoạch và Đầu tư, Bộ Tài chính, các Bộ, ngành địa phương liên quan tổ chức thực hiện các nội dung của Quyết định này.
Quyết định có hiệu lực thi hành sau 15 ngày, kể từ ngày đăng công báo.